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科学家绘出人类与病毒蛋白质间相互作用图谱

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美国哥伦比亚大学的研究团队研发了一种能够推断病毒蛋白质和人类蛋白质之间相互作用的计算框架。通过这种方法,他们获取了大量关于病毒如何感染人类的详细信息,并绘制了已知所有能感染人类的病毒与其侵入细胞之间蛋白质相互作用的全景图。这项相关研究成果最近发表在《细胞》期刊上。

病毒是细胞内的寄生微生物,它们利用蛋白质之间的互动来劫持细胞机制,而细胞也依赖这种相互作用来触发针对病毒入侵的免疫反应。因此,理解蛋白质间的相互作用对于揭示病毒与宿主细胞的关系至关重要。

目前,科学家主要通过高通量方法来研究蛋白质间的互动,尽管这种方法获取了许多新发现,但其扩展性不足也限制了研究的深入。此次,哥伦比亚大学的研究人员开发的P-HIPSTer计算框架,利用蛋白质结构信息来推断病毒蛋白与人类蛋白之间的相互作用,能够有效弥补高通量方法的扩展性不足问题。

借助P-HIPSTer,研究团队对一千多种已知可感染人类的病毒及其编码的约一万三千种蛋白质进行了详细研究,最终绘制出了人类与病毒之间蛋白质互动的图谱。该图谱涵盖了约28.2万个潜在相互作用的蛋白质对,为人类免疫学和传染病研究提供了重要的生物学信息。

除了确认人类与病毒蛋白质的相互作用外,P-HIPSTer还帮助研究人员获取了大量关于病毒如何感染人类细胞并导致疾病的信息,例如雌激素受体在调节寨卡病毒感染中的作用、人乳头瘤病毒如何致癌、病毒如何影响人类基因组等。

科学家表示,目前对于病毒蛋白质与人类蛋白质相互作用的理解仍然有限,他们希望新绘制的图谱能为科研团队提供更多研究资源,帮助获取更多生物学信息。接下来,他们计划将P-HIPSTer应用于更复杂的病原体研究,比如寄生虫和细菌;未来,他们可能用这一工具来研究影响农作物或牲畜的病毒或病原体。(记者 刘海英)

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